由于为20种氨基酸编码的密码子有61个,因此有的氨基酸可以有几个不同的密码子编码,如亮氨酸有6个,精氨酸也有6个,这一-现象称为密码的简并性。编码同一种氨基酸的密码子,称为同义密码子。密码的简并性对维持生物物种的稳定性有重要意义。密码的简并性可以减少突变的有害效应。如果密码不简并,20种密码足以编码20种氨基酸,那么就会有44种密码子导致肽链合成的终止,造成终止突变的可能性要大得多,而肽链终止突变常导致蛋白质失活,而个别氨基酸的替换相对害处要小得多,而且由于密码的简并性,DNA链上个别碱基的改变不一定 导致氨基酸的改变,这更减少了由于突变造成的恶果。
在密码子的3个碱基中,专一性主要取决于头两位碱基,第三个碱基比前两个碱基专-性较小,因此,与反密码子(在tRNA上)互补配对时,第三个碱基有较大的灵活性,当第三位碱基发生突变时,仍可翻译出正确的氨基酸，密码的这一特性称为密码的变偶性或密码的摆动性(wobble)。密码的变偶性减少了密码阅读时的误差,增加了翻译的准确性。
